目前深圳到香港走的最多的是皇崗口岸，文錦渡口岸和深圳灣口岸，這3個(gè)口岸都有著各自的優(yōu)勢(shì)，皇崗口岸24小時(shí)都可以通過(guò)，文錦渡口岸和深圳灣口岸只能通過(guò)到晚上10點(diǎn)，深圳到香港貨物通關(guān)時(shí)間是海關(guān)根據(jù)每個(gè)口岸的車(chē)流量以及一些政策所制定的。
  皇崗口岸是配合廣深高速公路建設(shè)新開(kāi)設(shè)的一個(gè)口岸。1985年5月開(kāi)始建設(shè)，1989年12月29日貨運(yùn)部分啟用通車(chē)，1991年8月8日客運(yùn)部分開(kāi)通使用。聯(lián)檢樓等產(chǎn)權(quán)歸屬仍不明晰，但使用權(quán)屬于政府。1994年11月3日起，開(kāi)辟兩條貨檢通道試行24小時(shí)通關(guān)，并設(shè)置了空車(chē)驗(yàn)放專(zhuān)用通道。1997年3月20日開(kāi)通了皇崗——落馬洲（港方口岸）穿梭巴士服務(wù)，為方便旅客過(guò)境開(kāi)辟了一條新的途徑。
  1999年10月，實(shí)行車(chē)輛自然分流通關(guān)，即除部分貨物、車(chē)輛按照有關(guān)規(guī)定維持現(xiàn)行做法從指定口岸進(jìn)出境外，其它行走文錦渡、沙頭角口岸的貨車(chē)在原行走口岸晚上關(guān)閘以后，可行走皇崗口岸24小時(shí)通關(guān)的貨車(chē)通道。2003年1月27日零時(shí)起，皇崗口岸實(shí)行旅檢通道24小時(shí)通關(guān)。2003年10月8日始，允許持有文錦渡、沙頭角口岸兩地牌的私家車(chē)、公務(wù)車(chē)和商務(wù)車(chē)在零時(shí)至6:30時(shí)從皇崗口岸出入境。